沙皇亚历山大二世在1878年5月28日批准了俄罗斯帝国国务委员会关于在托木斯克建立帝国大学的决定，并开始了托木斯克国立大学的建设和发展，托大由著名科学家、化学家门捷列夫和诺贝尔奖获得者巴甫洛夫建立。在托大百年办学史中，共有包括若列斯·阿尔费罗夫和哈拉尔德·楚尔·豪森在内的4位教授荣获诺贝尔奖，毕业生有100余名获得前苏联科学院和俄罗斯科学院院士称号，250多名俄国家奖金获得者。

托木斯克国立大学是欧洲大学协会和北极大学联盟成员之一，5-100计划重要成员之一，也是一个吸引创意人才的中心、先进思想的发源地、遵循俄联邦高等教育优秀传统的典范。在物理、数学、化学、力学、控制学、地质科学和生物学等教学领域托木斯克大学具有世界级的教学水平，在2021年公布的QS世界大学排名中托大位列全球第250位。

托木斯克国立大学设有23个论文评议委员会,其中13个是博士论文答辩委员会。托木斯克大学经过多年发展历程，在校生2.2万人，拥有23个系、2所分校，在物理、数学、化学、力学、控制学、地质科学和生物学等教学领域托木斯克大学具有世界级的教学水平。

俄罗斯托木斯克国立大学师资力量雄厚，有5000多名讲师，其中有600名教授，800名副教授，5名俄罗斯国家科学院院士，2名诺贝尔奖获得者，25名俄联邦国家基金获得者，295名博士后和800名博士在校任教。大学毕业生有100名获得前苏联国家科学院和俄罗斯国家科学院院士称号，50名毕业生获得过前苏联列宁科学教育基金。

托木斯克国立大学与国外大学联合办学已有悠久的历史。它是西伯利亚第一个开放性大学，也是第一个接受世界各国资助的学校。它的藏书和博物馆里陈列的物品来自欧洲、亚洲、美洲等不同的国家。目前，主要的合作大学是美国、德国、英国、法国、意大利、芬兰、荷兰、土耳其、中国、斯洛文尼亚、韩国、以色列、日本和蒙古的知名大学。托木斯克国立大学的教授也常被墨尔本大学、剑桥大学和海德堡大学等一些世界闻名的大学邀请前去讲座。每年互派留学生150名，互派讲师200名